Med sin tilknytning til enkeltprosjekter skiller prosjektsamarbeid seg fra ulike former for samarbeid mellom konkurrenter som har en viss varighet og ikke er begrenset til et enkeltstående prosjekt. Et arbeidsfellesskap som for eksempel består i at foretak på varig basis deler felles lokaler, utstyr og personell vil ikke anses som et prosjektsamarbeid. Hvorvidt et slikt samarbeid rammes av konkurranseloven § 10 vil måtte vurderes konkret.
Dersom et samarbeids tyngdepunkt ikke er å inngi et felles tilbud i en anbudskonkurranse, men eksempelvis et samarbeid om forskning og utvikling eller felles produksjon, finnes det egne kapitler om dette i EU-kommisjonens reviderte retningslinjer for horisontalt samarbeid (se lenke nederst på siden). Disse omhandler også gruppefritakene for forsknings- og utviklingsavtaler og spesialiseringsavtaler som unntar slike avtaler på generelt grunnlag hvis visse vilkår er oppfylt.
Samarbeid som resulterer i opprettelse av et fellesforetak som på varig grunnlag ivaretar alle funksjoner som hører inn under en uavhengig økonomisk enhet (såkalte fullfunksjons fellesforetak), blir vurdert under fusjonskontrollen.